Shotgun文库构建及测序

概述: Shotgun文库构建是将目的DNA用机械剪切的方法随机剪切成合适的小片段,并与载体连接构建的文库。Shotgun文库构建及测序有以下应用: 小型基因组测序,包括:病毒、噬菌体、野....

概述:

  Shotgun文库构建是将目的DNA用机械剪切的方法随机剪切成合适的小片段,并与载体连接构建的文库。Shotgun文库构建及测序有以下应用:
  小型基因组测序,包括:病毒、噬菌体、野生质粒等;
  BAC/Fosmid克隆测序;
  基因筛选;
  9K以上且未知参考序列的长片段测通。

技术路线

 

研究内容

  (1)文库构建完成后进行分析鉴定,包括库容量、插入片段大小、随机性、Blast结果等;
  (2)大规模测序组装完成后,进行组装评价,包括平均覆盖度、低质量区域、特殊结构等。